第四十五條 海事管理機構應當建立健全船員管理的監督檢查制度，重點加強對船員注冊、任職資格、履行職責、安全記錄，船員培訓機構培訓質量，船員服務機構誠實守信以及船員用人單位保護船員合法權益等情況的監督檢查，督促船員用人單位、船舶所有人以及相關的機構建立健全船員在船舶上的人身安全、衛生、健康和勞動安全保障制度，落實相應的保障措施。

第四十六條 海事管理機構對船員實施監督檢查時，應當查驗船員必須攜帶的證件的有效性，檢查船員履行職責的情況，必要時可以進行現場考核。

第四十七條 依照本條例的規定，取得船員服務簿、船員適任證書、中華人民共和國海員證的船員以及取得從事船員培訓業務許可、船員服務業務許可的機構，不再具備規定條件的，由海事管理機構責令限期改正；拒不改正或者無法改正的，海事管理機構應當撤銷相應的行政許可決定，并依法辦理有關行政許可的注銷手續。

第四十八條 海事管理機構對有違反水上交通安全和防治船舶污染水域法律、行政法規行為的船員，除依法給予行政處罰外，實行累計記分制度。海事管理機構對累計記分達到規定分值的船員，應當扣留船員適任證書，責令其參加水上交通安全、防治船舶污染等有關法律、行政法規的培訓并進行相應的考試；考試合格的，發還其船員適任證書。

第四十九條 船舶違反本條例和有關法律、行政法規規定的，海事管理機構應當責令限期改正；在規定期限內未能改正的，海事管理機構可以禁止船舶離港或者限制船舶航行、停泊、作業。

第五十條 海事管理機構實施監督檢查時，應當有2名以上執法人員參加，并出示有效的執法證件。 　　海事管理機構實施監督檢查，可以詢問當事人，向有關單位或者個人了解情況，查閱、復制有關資料，并保守被調查單位或者個人的商業秘密。 　　接受海事管理機構監督檢查的有關單位或者個人，應當如實提供有關資料或者情況。

第五十一條 海事管理機構應當公開管理事項、辦事程序、舉報電話號碼、通信地址、電子郵件信箱等信息，自覺接受社會的監督。

第五十二條 勞動保障行政部門應當加強對船員用人單位遵守勞動和社會保障的法律、法規和國家其他有關規定情況的監督檢查。